《刺客信条：兄弟会》剧情主要围绕主角戴斯蒙德·迈尔斯（Ezio Auditore）的视角展开，讲述其作为阿萨辛刺客后裔的成长与使命。以下是核心剧情梳理：

一、核心主线

记忆回溯与逃亡

戴斯蒙德因基因记忆被圣殿骑士组织绑架，利用“阿尼姆斯2.0”机器回溯至祖先艾吉奥的记忆，发现伊甸碎片（苹果）的线索。为保护碎片，他与露西·斯提尔曼、肖恩·黑斯廷斯、瑞贝卡·科瑞尔逃亡至意大利蒙特里久尼，以奥迪托雷庄园为临时据点。

伊甸碎片与目标

伊甸碎片是古代神器，传说拥有统治世界之力。各势力争夺碎片，戴斯蒙德需找到所有碎片并摧毁以阻止灾难。他首先前往佛罗伦萨，与祖先记忆中的导师Leonardo相遇，但未能直接获得碎片。

历史任务与传承

戴斯蒙德在意大利期间，需完成多项历史任务（如保护Viana围城战、暗杀Cesare Borgia等），同时探索文艺复兴时期的意大利社会。他逐渐意识到，真正的目标是通过传承阿萨辛精神延续刺客组织。

二、关键支线与角色

家族与记忆

戴斯蒙德与妹妹Claudia的关系复杂，她曾因父亲被处决而与组织对立，后逐渐转向刺客事业。游戏通过回忆片段揭示两人过去。

神秘组织

共济会（全视之眼）是游戏中的核心谜团组织，其象征与剧情发展密切相关。戴斯蒙德在探索中逐渐揭开其秘密。

重要任务

- 艺妓任务：

在罗马，戴斯蒙德需与母亲对话，完成暗杀目标以揭露Cesare的暴虐。

- 达芬奇失踪：DLC《达芬奇的消失》扩展了剧情，涉及艺术与科学的秘密。

三、结局与主题

游戏以戴斯蒙德建立新阿萨辛据点并传承刺客精神结尾，强调“锁链是困不了我的”信念。通过历史与现实的交织，探讨自由、责任与牺牲的主题。

以上剧情基于游戏主线和关键任务梳理，未涉及细节分支。