2009年MAMA亚洲音乐颁奖典礼，东方神起仅由细亚俊秀、英雄在中、秘奇有天三人出席，主要原因如下：

成员与SM的合约纠纷

2009年7月底，东方神起与所属经纪公司SM娱乐发生专属合同纠纷，导致成员关系紧张。SM以“评选不公”为由，宣布旗下Super Junior、少女时代等艺人不参加当年MAMA。

法院判决支持成员独立活动

在诉讼期间，法院裁定授予东方神起三名成员“自由身”，允许其独立开展活动。这一判决为三人后续单独出席颁奖典礼提供了法律支持。

MAMA的特别邀请

尽管SM拒绝参与，但Mnet亚洲音乐奖方仍向细亚俊秀、英雄在中、秘奇有天三人发出了正式邀请。三人认为通过音乐盛典向粉丝表达歉意和感谢是合适的。

成员个人意愿与情感表达

三名成员表示，因长期海外宣传未能与粉丝见面，希望通过此次活动弥补遗憾。同时，在领奖感言中流露出对未出席成员的思念，强调团队感情未变。

总结：

此次三人单独出席是成员与SM纠纷的直接结果，法院判决和MAMA的特别邀请成为关键因素，而成员个人意愿则体现了对粉丝的尊重与团队情感的维系。