根据《偷星九月天》漫画设定及剧情分析，玄月离开黑月铁骑的主要原因可归纳为以下三点：

摆脱K先生的控制与阴谋

玄月发现K先生利用堕天使进行人体实验，并企图通过控制他们征服世界。他取下神经锁后，主动脱离黑月岛，与缪尔五世对抗，并策反了Q和九月。

保护弟妹与追求自由

玄月对黑月铁骑内部存在矛盾（如四月的暴力行为）感到失望，且不愿继续被束缚。他救下妹妹一月（因不忍见其溺亡）后，选择离开以追求真正的自由。

身份转变与理念冲突

离开后，玄月被元素针控制成为路西法，彻底与黑月铁骑决裂。他试图开辟“神的时代”，但这一理念与黑月铁骑的统治目标背道而驰，最终导致双方对立。

补充说明：

漫画中未明确交代玄月离开的具体时间线，但根据设定可推测其行动发生在波塞冬篇前后。- 九月作为玄月的重要伙伴，其出走与玄月反叛行为存在关联，但两者动机独立。