工程项目经理不履职的处理方式需根据具体情况和合同条款综合判断，主要处理流程和措施如下：

一、初步应对措施

沟通与提醒

通过正式会议、邮件或书面通知，明确指出其未履行的职责及对项目的影响，要求限期整改。

检查与记录

建设单位需检查人员配备、工作日志等，形成书面检查记录，为后续处理提供依据。

二、处罚措施

内部处罚

- 警告：

针对轻微失职，可口头或书面警告，并要求提交整改计划。

- 降级/解雇：若持续失职导致项目延误或质量隐患，可降级其职级或解除合同。

- 罚款：根据损失金额，按公司规定或相关法规处以罚款（如1万元）。

行业处罚

- 信用记录：

将不良行为记入个人信用档案，影响未来招投标资格（如3年禁标）。

- 吊销资质：若存在重大事故或违法行为，可吊销注册建造师资格证书。

三、法律途径

合同追责

依据招投标文件和合同约定，要求施工单位承担违约责任，赔偿损失。

行政投诉

向住房和城乡建设主管部门举报，要求介入调查并处罚。

四、预防与改进

明确职责与考核

制定详细的岗位职责清单，建立绩效考核机制，将履职情况与薪酬、晋升挂钩。

加强培训与监督

定期开展项目管理培训，强化责任意识；通过定期会议和审计监督履职情况。

注意事项

处理前应核实合同条款，优先通过协商解决；

罚款金额需符合相关法规，避免超量处罚；

重大处罚前应报相关机构备案，确保程序合法。

（综合参考）