杭州莫干山风景区位于浙江省湖州市德清县，而莫干山路主要位于杭州市西湖区。具体说明如下：

莫干山风景区归属

莫干山是浙江湖州市德清县的国家AAAA级旅游景区，属于湖州市管辖，与杭州市的行政区划无直接关联。

莫干山路所属区域

莫干山路横贯杭州市西湖区、拱墅区和余杭区，但根据权威信息，其核心路段（如武林门至三墩段）明确属于西湖区。该路段东侧为拱墅区，西侧为西湖区，是杭州重要的交通主干道。

总结：

莫干山风景区位于湖州市德清县，而莫干山路主要位于杭州市西湖区，部分路段延伸至拱墅区和余杭区。