根据《公司法》及相关法规，公司的基本管理制度由董事会制定。具体分析如下：

法律依据

《公司法》第四十六条明确规定，董事会行使“制定公司的基本管理制度”职权。

职权范围

董事会作为公司最高经营决策机构，负责制定体现企业战略方向和核心价值观的基本管理制度，为日常经营管理提供宏观指导。

与其他管理机构的区别

- 总经理/经理：

负责具体规章的制定，细化基本制度并指导执行；

- 股东大会：主要决定重大事项（如合并、分立等），不直接参与管理制度制定；

- 监事会：负责监督董事会执行情况，而非制定制度。

实施建议

董事会可授权下属部门（如人事部）起草具体制度，但需经董事会审核通过后方可生效。

综上，基本管理制度由董事会制定，确保企业运营的规范性与战略一致性。