根据相关法律规定，手机店被扣押的手机退还时间需根据案件性质和公安机关的处理流程确定，具体如下：

一、与案件无关的财物处理

解除扣押时间

若手机经查与案件无关，公安机关应在 3日内解除扣押并退还。

特殊情况处理

若因证据保全等特殊原因需延长，需经县级以上公安机关负责人批准，但最长不得超过30日。

二、与案件有关的财物处理

一般情况

若手机涉及刑事案件，需等待案件侦查终结，通常需 30-60个工作日后返还。

复杂案件延长

对于重大、复杂的案件，经公安机关负责人批准，扣押期限可延长30日，但需及时书面告知当事人。

三、注意事项

主动申请退还

若超过法定期限未获退还，可主动向公安机关申请，但需提供充分证据证明手机与案件无关。

保留维权证据

在整个过程中，建议保留与扣押相关的沟通记录、申请文件等，以备后续维权使用。

四、法律依据

《刑事诉讼法》第一百四十一条：

对查封、扣押的财物、文件，经查与案件无关的，应当在三日以内解除查封、扣押，予以退还。

《公安机关办理行政案件程序规定》第一百一十二条：扣押、扣留、查封期限为三十日，情况复杂的，经县级以上公安机关负责人批准，可以延长三十日。

建议被扣押手机时及时与公安机关联系，确认手机性质及处理进度，避免因信息滞后影响权益。