关于祖屋长期未居住的继承问题，需根据继承法及相关法律规定进行判断，具体可分为以下情况：

一、继承前提条件

继承时被继承人已去世

继承必须以被继承人死亡为前提，且需办理死亡证明等法律手续。

遗产为被继承人个人财产

继承的祖屋需是被继承人生前独立所有的财产，若存在共有情况需先确定份额。

二、继承方式

遗嘱继承优先

若被继承人生前立有有效遗嘱（如公证遗嘱、自书遗嘱等），则按遗嘱指定继承人继承，无需考虑居住情况。

法定继承顺序

若无遗嘱或遗嘱无效，则按《民法典》第一千一百二十七条规定的顺序继承：

- 第一顺序：

配偶、子女、父母；

- 第二顺序：兄弟姐妹、祖父母、外祖父母。 继承开始后，由第一顺序继承人继承，第二顺序继承人不参与继承；若无第一顺序继承人，则由第二顺序继承人继承。

三、特殊情况处理

继承人协商一致

继承人可协商决定房屋归属，例如通过补偿方式解决份额争议，协商不成的可请求调解或诉讼。

农村祖屋的特殊性

若祖屋位于农村，需注意土地性质（如是否为集体土地）。若为集体土地，继承权可能受到土地政策限制，需参照《土地管理法》相关规定处理。

四、争议解决途径

协商或调解：

继承人可尝试协商分配或请求村民委员会、乡镇调解委员会调解；

诉讼：协商失败时，可通过诉讼主张继承权，法院将依据法律规定和证据判定份额。

总结

祖屋长期未居住的继承权归属，核心在于判断是否存在有效遗嘱及继承人的法律资格。建议继承人及时联系公证机构办理遗嘱（若有），并保留沟通记录以备后续可能出现的争议。