电子显微镜（EM）能观察到的结构主要分为亚显微和纳米级水平，具体如下：

亚显微结构

- 细胞器内部结构：

如线粒体、内质网、高尔基体、核糖体等，可清晰显示其形态和分布。 - 细胞核细节：包括核膜、核仁、染色体（需经染色或电镜特殊处理）等。 - 细胞膜与细胞壁：可观察其厚度、磷脂双分子层等结构。

纳米级结构

- 蛋白质与核酸：

如DNA双螺旋结构、蛋白质折叠细节等。 - 纳米颗粒与材料：用于研究生物大分子复合物、药物分子等。

其他应用

- 生物样本分析：

观察细胞切片、组织横切面中的细小纹路和细胞体结构。 - 前沿技术：如扫描隧道显微镜（STM）、原子力显微镜（AFM）等，可观察原子表面形貌。

总结：电子显微镜通过高能电子束实现高分辨率成像，能揭示细胞内亚显微结构及纳米级细节，是生物学、医学等领域的重要工具。