PE系统作为轻量级操作系统，具有以下主要缺点：

一、稳定性问题

内存要求高 ：需最低256MB RAM，低配置设备可能无法运行。

驱动支持不足：

无法加载完整硬件驱动，部分设备（如声卡、网卡）可能无法识别。

系统崩溃风险：

运行72小时后可能因资源不足强制重启，且蓝屏等错误更易发生。

二、功能限制

协议支持不全：

虽支持IPv4/IPv6，但不支持IPX/SPX等协议，限制网络功能。

运行环境受限

- 32位PE无法运行16位应用，64位PE无法运行32位应用；

- 不支持.NET Framework及Windows操作系统功能（如打印管理、终端服务）。

软件兼容性差：

多数商业软件无法直接运行，需依赖兼容层或虚拟机。

三、用户体验问题

操作复杂度高：

需手动分区、加载驱动，易因误操作导致数据丢失或硬件损坏。

界面简陋：

无图形化界面，依赖命令行操作，学习成本较高。

捆绑软件风险：

部分PE工具可能捆绑推广软件或恶意程序。

四、其他局限性

文件系统限制：无法直接访问硬盘驱动器（如用户配置文件、多媒体资源）；

性能瓶颈：运行速度较慢，无法流畅运行大型游戏或复杂应用。

建议：PE系统更适合系统修复、驱动安装等特定场景，普通用户建议优先使用Windows安装光盘或U盘启动工具。若需提升稳定性，可选择经过验证的轻量化系统（如Windows PE专业版），但需注意驱动和软件兼容性。