Windows 98系统支持的分区格式主要有以下两种：

一、主要分区格式

FAT16

作为DOS和Windows 95的原始文件系统，几乎所有Windows版本（包括Windows 98）均支持FAT16。 - 限制：最大仅支持2GB分区容量，且每个分区最多65,535个簇，随着容量增大空间浪费严重。

FAT32

是FAT16的增强版本，支持最大2TB（2048GB）的分区容量，且簇大小更小，空间利用率更高。 - 兼容性：Windows 98原生支持，且能被后续Windows版本（如95/98/2000/XP等）识别。

二、使用建议

小容量硬盘：

若硬盘容量≤2GB，FAT16即可满足需求；若>2GB，建议使用FAT32以节省空间。- 大容量硬盘：Windows 98原生不支持NTFS（最大4GB分区），需通过第三方工具（如DM或PQ）实现大容量分区。- 系统盘与数据盘：C盘（系统盘）建议使用FAT32，数据盘可根据容量选择FAT16或FAT32。

三、注意事项

分区工具：Windows 98不支持系统内分区，需通过DOS或第三方分区工具（如DiskGenius）进行分区操作。- 文件系统限制：FAT格式不支持权限管理、加密等高级功能，若需这些特性，需使用NTFS。

综上，Windows 98系统的分区格式以FAT16和FAT32为主，需根据硬盘容量和需求选择，并注意操作规范以避免数据丢失。