装系统时使用的文件格式主要有以下几种：

ISO：

ISO文件是一种光盘镜像格式，用于存储系统镜像文件。你可以将ISO文件解压，然后将其中的系统镜像文件（通常是一个650MB左右的文件）复制到U盘或其他存储介质中进行安装。

GHO：

GHO是Ghost软件使用的备份格式，通常包含一个硬盘分区的镜像文件（如HD4.gho）和一个系统镜像文件。在安装系统时，如果ISO文件中没有GHO文件，则可能是安装版系统，并且会有I386文件夹，可以在DOS下运行i386里面的winnt或者winnt.bat来安装系统。

FAT32：

FAT32是一种较旧的文件系统格式，支持的最大文件大小为4GB，适用于早期的Windows系统（如XP）以及一些移动存储设备。在安装Windows 7及以上版本时，通常建议使用NTFS格式，因为NTFS提供了更好的文件管理和安全性。

NTFS：

NTFS是Windows NT及其后续版本（如Windows 2000、Windows XP、Windows Server 2003、Windows Server 2008、Windows Vista和Windows 7）的标准文件系统。NTFS支持更大的文件、更好的数据保护和恢复功能，以及更高级的文件权限管理。

建议

Windows 7及以上版本：建议使用NTFS格式，以获得更好的文件管理和安全性。

Windows XP：可以使用FAT32或NTFS格式。

安装介质：ISO文件是常用的安装介质格式，可以通过解压得到系统镜像文件。GHO文件适用于通过Ghost软件备份和恢复系统。

U盘启动：在制作U盘启动盘时，可以选择FAT32或NTFS格式。如果使用电脑店等第三方工具，通常支持ISO和GHO两种格式。

根据你的具体需求和系统版本，选择合适的文件格式可以确保系统安装的顺利进行。