绿云系统存在以下缺点：

用户体验差：

绿云系统的设计不够人性化，用户体验不佳。有用户反映，绿云系统难用，操作繁琐，前台新员工需要很长时间学习适应。

系统稳定性问题：

绿云系统之前出现过瘫痪一周的严重事故，这表明其系统稳定性有待提高。

外挂软件空置率高：

绿云系统的外挂软件空置率较高，这意味着系统在实际应用中可能无法充分发挥其功能。

价格相对较高：

尽管绿云系统采用了云计算模式降低了硬件成本和维护成本，但其价格仍比同类产品贵，这可能会让一些预算有限的中小企业望而却步。

成熟度不足：

有观点认为绿云系统不是一个成熟的商业软件，可能存在一些潜在的问题和风险。

综上所述，绿云系统在用户体验、系统稳定性、外挂软件使用率、价格以及成熟度方面存在一定的不足。企业在选择云服务提供商时，建议综合考虑这些因素，以确保选择到最适合自己的解决方案。