Windows系统主要采用以下文件系统来组织和管理文件：

一、主要文件系统类型

FAT系列

- FAT16：

早期Windows版本常用，支持最大2GB分区容量，兼容性强但安全性较低。

- FAT32：扩展了FAT16功能，支持最大2TB容量，仍保持较好兼容性。

NTFS（New Technology File System）

- 从Windows NT系统开始使用，提供更快的读写速度、增强的安全性和权限管理功能（如访问控制列表ACL）。现代Windows系统（如Windows 10/11）默认采用NTFS。

exFAT（Extended File Allocation Table）

- 作为FAT的升级版，支持更大存储容量和更长文件名，适用于需要扩展存储的场景。

二、文件组织结构

树形结构：

Windows采用树形目录结构组织文件，以“我的电脑”为根目录，包含子目录（如“文档”“图片”等）。多级目录结构采用树形数据结构，便于层次化管理。

三、其他相关说明

文件类型标识：通过扩展名区分文件类型（如.exe可执行文件、.doc Word文档、.dll动态链接库等）。

系统文件格式：.sys（系统文件）、.ini（配置文件）、.bat（批处理脚本）等特定扩展名用于存储系统级信息。

四、历史演变

Windows XP及之前版本主要使用FAT32文件系统。

Windows Vista及后续版本逐步推广使用NTFS。

Windows 8及以后版本支持ESD（Extensible Storage Device）映像文件格式。

综上，Windows系统文件系统以NTFS为核心，兼顾兼容性、安全性和性能需求，同时保留FAT系列文件格式以支持老旧设备。