根据权威信息源综合分析，系统U盘格式选择需根据使用场景和需求决定，具体推荐如下：

一、主流格式对比

NTFS

- 优势：

支持大文件（超过4GB）、文件权限管理、数据恢复能力强，兼容Windows系统稳定。 - 适用场景：仅Windows系统使用，或需长期保存大文件（如高清视频、游戏安装包）。 - 注意事项：非Windows系统可能无法识别NTFS分区，且长期使用可能缩短U盘寿命。

FAT32

- 优势：

兼容性极强，支持Windows、Mac、Linux等多系统，文件大小限制为4GB。 - 适用场景：多平台文件传输，或需频繁在不同操作系统间切换。 - 缺点：无法存储超大文件，且部分旧设备可能不兼容。

exFAT

- 优势：

支持大文件（超过4GB），兼容性优于FAT32，适合多平台使用。 - 适用场景：跨平台文件传输，但需注意部分系统（如XP/Vista）需更新补丁。 - 缺点：兼容性较差，可能导致部分设备无法识别U盘。

二、系统安装建议

Windows系统：优先使用NTFS格式，可通过Windows官方工具（如Windows to Go）直接写入镜像。- 多平台使用：选择exFAT格式，但需提前确认设备兼容性。- 通用场景：FAT32格式平衡了兼容性与文件大小限制，适合大多数用户。

三、注意事项

格式化前建议备份重要数据，避免数据丢失。- 部分设备可能对特定格式有硬件限制，需根据实际使用场景选择。