系统发生分析（Systematics）是生物学中用于研究生物进化关系和系统发育的方法，其核心目的是通过比较生物特征或遗传信息，构建物种进化树（phylogenetic tree）以揭示生物形成或进化的历史。以下是具体说明：

一、基本定义

系统发生分析通过分析生物的形态学、遗传学等特征，或直接利用核酸序列数据，构建反映物种间亲缘关系的分类系统。例如，形态学特征包括生物体大小、颜色、触角数量等，而现代系统发生学主要依赖DNA或蛋白质序列信息。

二、核心概念

系统发生树（Phylogenetic Tree）

以树状结构展示物种间的进化关系，树根代表最早出现的分类单元，分支代表进化分支。

系统发生学（ Phylogenetics）

研究物种进化关系的学科，通过特征比较或遗传信息分析推断物种间的亲缘关系。

三、研究方法

经典系统发生学

依据物理或表型特征（如形态、行为）进行比较，例如通过形态相似性推断进化关系。

现代系统发生学

依赖遗传信息（如DNA序列、蛋白质分子）分析，通过分子进化技术（如系统发育分析）构建进化树。

四、应用领域

物种分类：

明确物种间的分类地位和亲缘关系；

进化起源研究：例如现代人类起源研究，通过线粒体DNA证据表明所有现代人源自非洲女性；

保护生物学：辅助保护濒危物种，通过进化关系评估保护优先级。

五、与其他概念的区别

需注意与“系统发生分析”（System Failure Analysis）区分，后者是工程学领域用于分析系统故障原因的方法，与生物学进化研究无关。