魅族MX搭载的是 Flyme OS系统，这是魅族公司基于Android系统深度定制的用户界面。Flyme OS针对魅族MX进行了优化，提供了更符合魅族用户习惯的操作体验。虽然早期版本的魅族MX曾搭载Android 2.3操作系统，但后续版本已经升级至基于Android 4.0的Flyme OS 2.0。此外，有信息称魅族MX （M030､M031）使用Cortex-A9双核处理器，MX （M032）使用Cortex-A9四核处理器，且MX拥有1GB RAM。