冷链运输系统的主要职能包括以下几个方面：

冷链运输

冷链运输是冷链物流系统中负责将冷链商品从发货方安全、及时地运送到收货方的环节。在运输前，商品通常需要进行预冷处理，并在运输过程中保持适宜的温度，以确保商品质量不受损害。

温度控制

冷链运输系统需要配备先进的温控设备，如冷藏车、冷藏集装箱等，以在运输过程中保持货物所需的低温环境，防止温度波动对商品质量造成影响。

信息整合与优化

冷链运输管理系统能够整合和优化运输资源，包括车辆、司机等，通过合理调配，提高运输效率，减少运输成本和时间。系统还可以提供最优的配送路径，帮助司机选择最合适的路线进行运输。

库存管理

冷链运输管理系统能够实时监测和记录货物的温湿度情况，帮助进行库存管理和货物分配，确保货物在储存和运输过程中始终处于适宜的温度环境中。

质量与安全

通过严格控制温度，冷链运输系统可以有效减少微生物的生长和繁殖，降低食品腐败变质的风险，从而保障食品安全和商品质量。

预警与提醒

冷链运输管理系统具备温度监测和预警功能，当温度超出设定范围时，系统会自动发出警报，提醒相关人员及时处理，确保货物在运输过程中的安全。

综上所述，冷链运输系统在保障食品等易受温度影响的产品质量与安全方面发挥着至关重要的作用，通过一系列先进的技术和管理手段，实现了从产地到消费者手中的全程温度控制和管理。