苹果MacBook搭载的是 macOS系统。macOS是苹果公司开发的基于图形用户界面的操作系统，为麦金塔系列电脑的主操作系统。它包含两个主要部分：核心名为Darwin，是以BSD源代码和Mach微核心为基础，由苹果公司和独立开发者社区合作开发；及一个由苹果公司开发，名为Aqua的专利的图形用户界面。macOS是全世界第一个基于FreeBSD系统采用“面向对象操作系统”的全面的操作系统。

用户可以在Mac上安装虚拟机来运行Windows系统，或者使用Bootcamp助手来安装Windows系统，这样可以在开机时选择启动MacOS还是Windows。此外，还可以选择全格式化安装Windows系统，使用Mac的硬件及电池性能。

截至2024年，最新的macOS版本是OS X Yosemite。用户可以通过“关于本机”功能查看当前安装的macOS版本，并确定是否需要进行更新。