关于C盘系统文件系统的选择，综合多个权威信息源的建议如下：

一、推荐使用NTFS文件系统

技术优势

NTFS是Windows NT家族（包括Windows XP至Windows 11）的专用文件系统，支持大文件存储（单个文件最大2TB）、文件加密、访问控制、磁盘配额等高级功能，且具有更好的错误检测与修复能力。

系统需求

所有主流Windows操作系统（如Windows 7及以上）均要求系统盘（C盘）格式化为NTFS，以支持大容量存储和系统功能。

二、特殊场景补充说明

DOS兼容性

若需频繁进行DOS操作（如系统修复），可选择FAT32文件系统。但现代操作系统（如Windows XP及以上）已不再完全支持FAT32的分区大小限制（超过32GB）。

分区大小建议

8GB以下：

FAT32性能更优，碎片较少

8GB及以上：NTFS更高效，支持动态扩展分区

三、注意事项

系统关键文件保护

C盘需保留以下系统文件（切勿删除）：

`Bootmgr`、`ntldr`、`kernel32.dll`等核心操作系统文件

`pagefile.sys`、`hiberfil.sys`等系统工具文件

删除这些文件会导致系统崩溃

激活主分区

若使用GPT分区，需通过DiskGenius等工具手动激活主分区

综上， C盘系统推荐使用NTFS文件系统，既满足现代操作系统的需求，又能兼顾大容量存储与数据安全。若存在特殊兼容性问题，再考虑使用FAT32。