手机被公安机关扣押后的归还时间需根据案件性质和调查进展确定，具体规定如下：

一、一般情况（与案件无关）

扣押后立即解除

公安机关在侦查阶段经检查确认手机与案件无关时， 应当于3日内解除扣押并返还。

最长不超过48小时

部分情况下，经县级以上公安机关负责人批准，扣押时间可延长至 48小时（24小时+24小时）。

二、案件相关情况

作为证据保留

若手机内信息对案件调查至关重要，可能被暂扣至案件终结。此时需出具扣押证明，注明返还期限，通常 数月甚至更久。

行政案件与刑事案件的差异

- 行政案件：

扣押期限一般为30日，复杂可延长30日，总时长不超过60日。

- 刑事案件：扣押至案件审结，但无关物品需在3日内解除。

三、特殊情形

没收与拍卖：若手机被依法没收（如涉案），需在作出处罚决定后15日内拍卖或上缴国库。

超期未处理：超过法定期限未解除扣押的，公安机关应主动退还。

四、权利救济

若对扣押行为有异议，可：

申请解除扣押：

提供证据证明手机与案件无关；

申诉或控告：

向作出决定的公安机关或上级机关申诉。

以上时间节点均依据《中华人民共和国刑事诉讼法》《公安机关办理行政案件程序规定》等法律法规制定，具体执行中可能因案件复杂度有所调整。