根据不同的使用场景和系统需求，文件系统格式的选择需考虑兼容性、容量限制和功能需求。以下是综合建议：

一、Windows系统分区格式选择

系统盘（C盘）

推荐NTFS：

支持大容量存储（最大2TB），提供文件加密功能，且与Windows系列系统深度集成，安全性较高。

历史建议：早期Windows 95/98/Me系统使用FAT32，但因容量限制（最大2GB分区）已不适应大容量硬盘，故不再推荐。

数据盘/其他分区

推荐FAT32：

兼容性强，支持DOS、Windows全系操作系统，适合存储大文件（最大4GB单文件）。

EXFAT：适用于U盘等移动存储设备，解决FAT32在超大容量设备上的碎片化问题。

二、其他操作系统文件系统推荐

macOS：推荐 HFS+（macOS原生格式），支持文件加密和高级权限管理。

Linux：推荐 Ext4，提供大文件支持、事务处理和高级功能。

三、特殊场景补充说明

多系统共存：

若需同时安装Windows和Linux系统，需根据安装介质选择对应格式（如ISO镜像）。

系统安装方式：

手动安装时，Windows系统盘建议选择NTFS；

使用Ghost等工具一键安装时，格式由备份时决定。

旧系统兼容性：

FAT16因兼容性最佳，但仅支持2GB分区，仅适用于极小容量硬盘或特殊需求。

四、总结建议

Windows系统：系统盘用NTFS，数据盘用FAT32（或EXFAT）。

多系统环境：根据安装介质和需求选择ISO或GHO格式。

其他系统：macOS用HFS+，Linux用Ext4。