关于Windows系统提示“系统设置已更改”的原因及解决方法，综合搜索结果分析如下：

一、提示原因分析

系统资源初始化

部分系统设置（如外观、性能等）需在系统启动时加载，这些设置涉及程序运行环境配置，需重启explorer.exe等进程才能生效。

权限验证机制

当应用程序尝试修改系统级配置时，系统会弹出提示框要求管理员权限。这是Windows的安全机制，防止未经授权的修改。

组策略限制

若计算机处于企业或学校网络环境，组策略可能被管理员禁用或删除了部分系统设置。

软件冲突或系统错误

病毒感染、驱动问题或系统文件损坏可能导致此类提示异常出现。

二、解决方法

重启计算机

最直接有效的解决方式是重启电脑，使系统完成资源初始化和权限验证。

关闭安全软件临时限制

若提示与杀毒软件冲突，可尝试在安全模式下运行杀毒工具（如360安全卫士）。

检查组策略设置

若为网络环境，联系系统管理员确认是否为组策略限制。

修复系统文件或驱动

使用系统自带的`sfc /scannow`命令修复系统文件，或通过设备管理器更新驱动。

调整用户权限

若频繁出现此类提示，可尝试通过控制面板调整用户账户控制（UAC）设置，但需注意安全风险。

三、注意事项

谨慎处理系统设置：

非必要设置建议通过控制面板或组策略编辑器（gpedit.msc）进行修改，避免误操作导致系统不稳定。

专业帮助：若问题持续存在且无法自行解决，建议联系专业技术人员进行硬件检测或系统修复。

通过以上方法，可有效解决系统设置更改提示问题。若问题涉及复杂配置或硬件故障，建议优先通过系统内置工具或专业软件进行排查。