再贴现业务主要通过 中国票据交易系统进行电子化处理。上海票据交易所根据中国人民银行的要求，依托中国票据交易系统开发了再贴现业务子系统，为再贴现操作提供高效、安全、便捷的电子化处理平台。

具体流程如下：

申请提交：

贴出行通过电子商业汇票系统向中国人民银行发起再贴现业务申请，并将纸质申请材料交由中国人民银行进行审核。

审核处理：

中国人民银行货币信贷部门收到贴出人提交的书面申请后，按照相关要求进行审查。

额度控制与参数管理：

人民银行各级机构作为再贴现受理窗口在系统中电子化处理再贴现业务申请，同时可对再贴现业务实现额度控制和参数管理。

因此，再贴现业务主要在中国票据交易系统中进行操作，该系统为再贴现提供了高效、安全、便捷的电子化处理平台。