氯气主要作用于 呼吸系统。当氯气被吸入时，它会首先影响眼和上呼吸道，引起刺激反应，如羞明、流泪、咽痛和呛咳。随后，氯气会进一步深入肺部，作用于支气管、细支气管和肺泡，导致支气管炎、肺水肿等严重病变。此外，氯气还可以直接作用于心肌，特别是心脏传导系统。

氯气的毒性作用主要由氯化氢和次氯酸引起，其中次氯酸能够透过细胞膜破坏其完整性、通透性及肺泡壁的气-血、气-液屏障，使大量浆液渗透至组织，严重时甚至会导致死亡。

因此，氯气对呼吸系统的危害是最为显著的，其他系统如眼睛、皮肤和心脏等也可能受到一定影响，但程度较轻。在使用氯气时，必须采取适当的防护措施，避免吸入和接触。