企业在发工资时使用的系统主要有以下几种：

薪酬管理系统：

这类系统能够帮助企业实现自动化薪酬计算、发放、税务处理以及一些人力资源管理相关功能。其核心功能包括薪酬核算，根据企业设定的薪酬结构自动计算每个员工的工资，包括基本工资、绩效工资等，并支持自动生成员工工资条。

红海云薪酬核算系统：

该系统功能全面，计算稳定且效率极高，支持自动算工资、自动生成员工工资条，以及支持各地区币种汇率、各类福利津贴设置、社保、公积金、个税等申缴。它适合人员规模超50人以上的企业使用，能够避免因繁杂的数据让人工处理产生错漏。

易路软件易薪系统：

提供薪资管理软件，具有工资条发放功能，能够根据薪税计算结果自动生成工资条，并通过短信一键推送。该系统还支持自动解析工资表，无需特定模板。

WoYou工资：

这款产品以其卓越的性价比脱颖而出，设计了一套简洁高效的薪资处理流程，用户仅需三个步骤即可实现从薪资统计到资金到账的无缝对接，整个过程完全免费。

用友HR：

这是一款领先的人力资源管理软件，拥有完整的薪酬管理和绩效管理功能，并且具备日薪发放功能。该软件集成了薪资核算、考勤管理、社保公积金等模块，可以满足企业对薪酬管理的全方位需求。

快钱HCM：

这是一款强大的人力资源管理软件，具有强大的薪资核算功能，支持日薪发放，并且还可以自动计算员工加班、请假等情况，自动生成薪资条。

用友U8 HR：

这款人力资源管理软件拥有完善的薪酬管理和绩效管理功能，同时还具备日薪发放功能。该软件支持多种薪资结算方式，包括月薪、周薪、日薪等，并可以帮助企业进行员工档案管理、招聘管理、培训管理等。

招商银行薪福通：

该平台集成了薪酬代发、人事服务、财务服务、团体福利等多种功能，能帮助企业完成员工管理、发薪、企业网上报税、企业财务管理等多项工作。

全易通智能考勤工资核算系统：

该系统通过智能考勤系统软件，采集机器中原始打卡记录，进行统计分析，得出员工出勤日报表和出勤汇总表，再导入或输入工资项目的金额，系统自动计算出员工的实发工资金额以及所得税金额。

这些系统各有特点，企业可以根据自身规模和需求选择合适的系统来进行工资管理。对于大型企业，可能需要功能更为全面、系统稳定且支持多地社保福利和税率信息的系统，如红海云薪酬核算系统或用友HR等。对于中小型企业，则可以根据预算和实际需求选择功能相对简单、操作便捷的系统，如易路软件易薪系统或WoYou工资等。