企业选择自己做工厂系统的原因主要包括以下几点：

数据安全：

工厂内部存储着大量的敏感数据，如订单信息、客户资料和生产数据。自建服务器可以更好地保护这些数据的安全性，避免数据泄露给企业带来经济损失和信誉问题。

网络延迟和带宽：

工厂需要实时监控设备运行状态和生产过程，使用自建服务器可以减少网络延迟，提高监控和控制的实时性。同时，批量生产的工厂需要大量数据传输，自建服务器可以利用专用带宽，确保数据传输的稳定和快速。

灾备容灾：

工厂生产过程面临各种风险，如服务器故障、网络中断和自然灾害等。自建服务器可以在多个地点进行备份和容灾，保障系统的稳定性和可靠性，而使用公共云服务器可能面临不可抗力因素导致的系统故障和数据丢失。

定制化需求：

不同工厂的生产流程、管理模式和信息系统需求各不相同。自建服务器可以根据工厂的具体需求进行定制化开发，实现更符合企业需求的信息系统和管理软件。

预规划和灵活性生产：

数字化工厂技术可以在设计之初对工厂布局、产品生产水平与能力等进行预规划，帮助企业进行评估与检验。此外，数字化工厂系统能够根据市场需求的变化快速进行虚拟化仿真设计，缩短产品上市时间，提高产品竞争力。

节约资源、降低成本、提高资金效益：

通过数字化工厂技术进行产品的虚拟设计与验证，可以最大程度地降低物理原型的生产与更改，从而有效减少资源浪费，降低产品开发成本。

提升产品质量水平：

数字化工厂技术可以对产品设计、原料生产过程等进行严格控制和统筹安排，降低设计与生产制造之间的不确定性，提高产品数据的统一性，方便进行质量规划，提升质量水平。

长期成本节省：

虽然自建MES系统在初期需要投入大量时间和资金，但从长期来看，这种投资是值得的。市面上的商业MES系统通常需要支付高额的许可证费用、维护费用和升级费用，而自建系统可以避免这些长期的外部费用，并且在系统升级和维护方面拥有更多自主权。

技术积累和自主可控：

自己开发MES系统有助于企业积累技术经验，增强自主可控能力。通过自己开发，企业可以根据自身特点和业务流程进行深度定制，提高生产效率和管理水平。

综上所述，企业选择自己做工厂系统是为了保护数据安全、提高网络实时性和稳定性、实现定制化需求、应对灾备容灾问题，并考虑到长期成本节省和技术积累等因素。