系统机械能减小的情况主要包括以下几种：

摩擦力做负功：

当系统受到摩擦力作用，并且摩擦力对系统做负功时，系统的机械能会减少。摩擦力做负功意味着系统的一部分机械能转化为内能，导致机械能总量减少。

除重力、弹力以外的合外力做负功：

如果系统受到除重力和弹力以外的合外力作用，并且这个合外力对系统做负功，那么系统的机械能也会减少。这是因为合外力做负功意味着系统的一部分机械能转化为其他形式的能量（如热能）。

系统内部物体相对运动：

在包含多个物体的系统中，如果物体之间发生相对运动并产生摩擦，这种摩擦会消耗能量，导致整个系统的机械能减少。

系统对外界做功：

当系统对外界做功时，系统的机械能会减少。这是因为系统在对外做功的过程中，部分机械能转化为其他形式的能量（如热能）。

综上所述，系统机械能减小的主要原因是除重力、弹力以外的力做负功，这些力包括摩擦力、合外力等。当这些力对系统做负功时，系统的机械能会转化为其他形式的能量，从而导致机械能总量减少。