根据搜索结果，晋江被描述为“我市重要的河流”，而问题中提到的“系统”指代需要结合生态学概念进行解析：

晋江作为河流的生态属性

晋江作为一条河流，其本身属于自然地理系统的一部分，具体表现为水文系统或河流生态系统。这类系统由生物群落（如水生植物、鱼类、微生物等）与其非生物环境（如水文条件、矿物质、光照等）相互作用构成。

生态系统的定义

生态系统包含生物部分（生产者、消费者、分解者等）和非生物部分（水、空气、土壤等）。晋江的生态系统应包含河流中的所有生物（如藻类、鱼类、浮游生物等）及其生存环境（如水质、水流、底质等）。

选项分析

A选项（所有藻类植物）仅包含部分生物，不构成完整生态系统；

B选项（所有生物及其生活的环境）符合生态系统的定义；

C选项（全部的水和矿物质）仅包含非生物部分；

D选项（所有生物）未包含非生物环境。

结论：

晋江作为河流，其生态系统应选B选项，即“晋江中所有的生物及其生活的环境”。这一选项完整地涵盖了生态系统中生物与非生物部分的统一整体。