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cadd评估系统指什么

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CADD(Causal Annotation of Variants by Diversity)评估系统是一种用于基因组学中变异位点致病性预测的工具。它通过综合分析等位基因多态性、变异类型及进化保守性等因素,为每个变异位点提供量化评分,帮助研究人员理解其潜在的致病风险。

核心特点:

多因素综合评估

CADD结合了等位基因频率(多态性)、变异类型(如synonymous SNV)、进化保守性等九个维度,构建评分模型。

评分机制

RawScore:

模型直接输出的基础分数,分数越高表示该位点为有害突变的概率越高。

C-Score:在RawScore基础上进一步校正,考虑基因组内其他位点的进化压力,提供更可靠的致病性预测。

应用价值

用于疾病相关基因的变异筛选,辅助识别潜在致病基因;

在精准医疗中辅助制定个性化治疗方案。

应用场景:

遗传疾病研究:

如癌症、神经退行性疾病等,通过CADD评估致病风险基因;

药物研发:辅助设计针对特定变异的药物。

注意事项:

CADD评分需结合其他研究工具(如GOAT、PolyPhen)进行验证;

评分结果受限于数据库的覆盖范围和算法假设,需谨慎解读。

通过上述机制,CADD为基因组学研究提供了系统化的变异位点致病性评估框架,但仍需结合实验验证和临床数据进一步确认其临床意义。