士官在部队被没收手机的处理方式需根据具体情况和部队规定综合判断，主要分为以下几种情况：

一、违规使用手机的直接处理措施

警告或严重警告

若首次违规且情节较轻，通常给予口头或书面警告；若多次违规或情节严重，可能升级为严重警告。

收缴手机

部队会统一收缴违规手机，通常在以下场景发生：

- 集训、保密任务等特殊时段；

- 被领导发现使用后当场收缴。

“充公”处理

部分单位会将没收手机集中保管，直至士官本人提出申请或探亲时发还。

二、可能引发的后续影响

纪律处分

依据《中国人民解放军纪律条令》，违规使用手机可能受到以下处分：

- 警告、严重警告、记过、记大过、降职或撤职等。

评优评先受限

违规记录可能影响士官的立功表彰、优秀士兵评选等。

入党影响

严重违规者可能被取消入党资格，但需结合个人表现综合判断。

三、注意事项

部队规定差异：

不同单位对手机管理的严格程度不同，建议提前了解所在单位的具体规定。

主动认错的重要性：及时认错、写检讨并保证不再违规，可减轻处罚。

特殊情形处理：若因工作需要申请使用手机，需经师（旅）以上单位批准。

建议士官遵守部队规定，避免因小失大。若对处理结果有疑问，可通过正规渠道反映情况。