明朝海防系统是以卫所为核心构建的多层次、有纵深防御体系，主要包括以下组成部分：

一、核心防御层级

卫所制度

明朝在沿海重要城镇设置卫所，作为军事基地。根据地形和防御需求，卫所下设置千户所（5600人）和百户所（2800人），形成多层级编制。例如，广东全省设有8个卫城和29个千户所城，形成密集的防御网络。

水寨与信地

在出海口、航道交汇处设置水寨，并划拨周边海域为“信地”，形成海上防线。水寨负责驻守和巡逻，歼灭海上寇患，与陆地卫所形成互补。

二、配套防御设施

烽堠与墩台

沿海及重要节点设置烽堠和墩台，用于传递军情和防御外敌。这些设施与水寨、卫所形成联动机制，构成多层预警体系。

巡检司制度

设立巡检司统辖民兵，负责沿海巡逻、盘查奸细及维护治安。巡检司与水军协同作战，形成“陆聚步兵，水具战舰”的立体防御格局。

三、管理机制

层级指挥体系

海防由中央都司、都督府指挥，地方卫所主官负责具体执行。这种层级分明的管理方式确保了军令畅通。

海禁与海防结合

明朝实行海禁政策，限制民间海上活动，同时通过海防体系防范内外勾结。这种政策既维护了沿海稳定，又为海防提供了社会基础。

四、地理特征与区域差异

沿海广袤区域：

如广东、浙江等地，海防体系覆盖海岸线及岛屿，强调“御海上、固海岸、守内陆”的立体防御。

局部重点防御：如浙江浙地，通过卫所、寨堡及海岛构建精细化防御网络。

五、历史意义

明代海防体系是中国古代海防建设的集大成者，不仅有效抵御了倭寇、海盗等威胁，还保障了海上丝绸之路的安全。其制度设计对后世海防建设产生了深远影响。

（注：以上内容综合了明代海防体系的多方面研究，涵盖制度架构、地理特征及历史作用。）