发票系统清盘的主要原因包括以下几点：

税务合规性：

清盘有助于确保企业或个人遵守税务规定，避免因发票问题导致的法律风险。

数据准确性：

通过清盘，可以整理和归档发票的使用情况，确保每一份发票的流向都有明确的记录，防止发票丢失或管理不善导致的问题。

防止锁死：

例如，税控盘需要定期清盘，否则存有上一期申报信息时，下期纳税申报时税控盘可能会被锁死，无法再次申报纳税。

释放存储空间：

当税控盘存储的数据量达到上限或者出现故障时，清盘可以释放存储空间，确保税控盘正常运行。

管理便利性：

清盘后，企业和个人的财务数据更加清晰，便于未来的采购和销售策略制定，以及个人消费情况的了解。

政策遵循：

例如，一般纳税人在购买增值税专用发票前需要先到税务机关抄税后清盘，这是税务规定的一部分。

综上所述，发票系统清盘是税务管理中的一个重要环节，有助于确保税务合规性、数据准确性，防止系统锁死，并提高管理便利性。