松鼠作为动物，其生物结构层次中确实包含系统这一层级，而植物则没有。这一差异主要源于两者在生理结构和功能组织上的根本不同。以下是具体分析：

一、植物缺乏系统层次的原因

器官独立性较强

植物的器官（如根、茎、叶）在结构和功能上相对独立，主要通过激素和机械信号进行协调，无需像动物那样通过神经-内分泌系统进行复杂调控。

进化适应的结果

植物通过细胞、组织、器官的直接协同作用完成光合作用、营养吸收等生理活动，系统层次在进化过程中未被完全演化出来。

二、松鼠具有系统层次的原因

器官间的高度分化与协同

松鼠作为哺乳动物，其器官（如消化系统、神经系统、运动系统）分工明确且高度协同，需通过神经系统进行精确调控，因此形成系统层次。

复杂生理功能的需要

动物需要应对环境变化（如捕食、迁徙），系统层次有助于整合不同器官的功能，提高生存效率。

三、细菌的特殊情况

单细胞与多细胞生物的差异

细菌是单细胞生物，部分种类可视为单细胞个体，无需器官和系统层次。而松鼠等多细胞动物则必须通过系统实现复杂功能。

四、种群以上生态层次的共同性

结构层次的递进关系

细菌、松鼠、桃树等生物在种群以上均存在个体、种群、群落、生态系统、生物圈等层次，这些层次反映了生物对环境资源的利用和生态关系的普遍性。

综上，松鼠具有系统层次是动物进化适应的产物，而植物因器官独立性和进化路径不同，未形成该层次结构。