核工程专业的设置情况如下：

清华大学：

核工程专业设在 工程物理系。

上海交通大学：

核工程专业隶属于 核科学与系统工程系。

浙江大学：

核工程是 能源工程学院的一个专业方向。

北京大学：

核能与核技术工程专业属于 物理学院。

中国科学技术大学：

核科学技术学院的前身是原子核物理和原子核工程系。

西安交通大学：

核工程专业培养核工程与核技术领域内的复合型高级人才。

东华理工大学：

设置有核科学与工程学院，开设核工程与核技术、辐射防护与核安全、核化工与核燃料工程三个本科专业。

兰州大学：

核化工与核燃料工程专业依托核科学与技术学院建设，该学院是国内高校核专业设置最齐全的院系之一。

哈尔滨工程大学：

虽然文档中没有具体提到哈尔滨工程大学的核工程专业归属，但根据其他核工程专业的设置情况，可以推测其可能隶属于核科学与工程学院或核科学与技术学院。

综上所述，核工程专业的系统归属主要取决于具体学校，常见的归属有工程物理系、核科学与系统工程系、能源工程学院、物理学院、核科学与工程学院或核科学与技术学院等。建议学生在选择学校和专业时，详细了解各学校的课程设置和系别设置，以便做出更合适的选择。