小米6出厂时搭载的操作系统是 MIUI 8.7，基于 Android 7.1.1深度定制。以下是详细信息：

基础系统版本

小米6最初发布时预装的是MIUI 8.7，该版本基于Android 7.1.1开发，属于当时旗舰机型常见的定制系统。

系统特性

- 性能：

搭载高通骁龙835处理器，采用Kryo 280架构，主频2.45GHz，配合Adreno 540 GPU，提供流畅体验。

- 屏幕：5.15英寸1080p AMOLED屏幕，支持90Hz刷新率（部分版本）。

- 功能：支持双卡双待、NFC、指纹支付、3D结构光、立体声扬声器等，系统内置“链式启动管理”和“三重保护”等安全功能。

可升级版本

由于MIUI 8.7发布较久，后续小米推出了MIUI 9、MIUI 10等更新版本，用户可通过刷机升级至这些版本以获得新功能（如应用双开、动态资源分配等）。

用户评价

不同用户对系统版本偏好差异较大，MIUI 10.4.3因稳定性高、广告较少，被部分用户评为“最好用”版本，但需注意需解锁BL锁并刷入第三方卡刷包。

综上，小米6原生系统为MIUI 8.7（基于Android 7.1.1），用户可根据需求选择升级至更高版本以体验新功能。