学校使用的查重系统主要有以下几种：

知网：

知网作为国内较为知名的学术资源平台，其查重系统具有覆盖面广、检测效果好的优势，被广泛应用于高校的毕业论文查重工作中。

维普：

维普作为另一家知名的学术数据库，也具有较高的检测准确率和安全性，被广泛应用于高校的毕业论文查重工作中。

Paperfree：

Paperfree作为一家新兴的查重系统提供商，其系统在查重速度和检测精度方面有着独特的优势，许多学校选择使用paperfree系统，不仅是因为其高效率和精准度，还因为其用户界面友好、操作简便。

Papertime：

Papertime的数据库与知网的数据库很相近，许多学校选择使用Papertime进行查重，因为其查重结果与知网相近，且百度Papertime官网查重非常方便。

万方：

万方也是这几年兴起的论文查重软件，数据库没有知网齐全，但也被一些学校采用。

源文鉴：

源文鉴系统具有知网95%的数据库，还包含大部分高校的自建库，目前是最接近知网的查重系统，误差一般在1%左右。

建议

初稿查重：建议使用Paperfree或Papertime等系统，因为它们查重速度快，且用户界面友好、操作简便。

定稿查重：建议使用知网或维普，因为它们的数据库更全面，检测精度更高，能够提供更准确的查重结果。

学校自建库：一些学校会有自己的自建库，这些库只能自己学校使用，建议优先使用学校提供的查重系统进行检测。

根据以上信息，你可以选择适合自己需求的查重系统进行论文查重，以确保查重结果的准确性和可靠性。