复式三层别墅在选择新风系统时，可以考虑以下几种类型：

双向流新风系统：

双向流新风系统通过同时进行送风和排风，可以更为快速地达到室内空气流通，与室外空气交换。这种系统适合需要较高空气流通性和快速换气的情况。代表产品包括维塔新风系统和古耐新风系统GN820等。

全热交换平衡式新风系统：

这种系统具有高热效率，可以利用室内空气加热或冷却新进入的新鲜空气，减少能量损失。不过需要在室内屋顶安装管道，并存在管道清洁问题，可能存在二次污染的可能。

增压式单向流新风系统：

增压式单向流新风系统可以有效保证室内空气置换彻底，不留死角。适合需要确保每个房间空气流通的情况，代表产品包括古耐新风系统GN810和松下管道新风系统。

自平衡式新风系统：

自平衡式新风系统能够自动调节每个末端风口的风量，以适应不同风压下的需求，从而保持风量在设计值。

湿控式新风系统：

湿控式新风系统通过湿度探测器感应室内湿度，从而调节风口截面大小以控制风量。

双向流热回收新风系统：

这种系统在送风和排风的同时，具有热量回收装置，能够实现能量平衡，提高能效。

根据以上信息，复式三层别墅在选择新风系统时，可以根据实际需求和预算，选择适合的系统类型。如果追求高效的空气流通和快速换气，双向流新风系统或全热交换平衡式新风系统是不错的选择。如果注重节能和环保，可以考虑带有热回收功能的双向流热回收新风系统。对于需要更高空气质量和静谧环境的用户，自平衡式或湿控式新风系统可能更为合适。