荣耀手机主要搭载的是 基于安卓操作系统的EMUI定制版。EMUI是华为自主研发的一款定制化安卓系统，注重用户体验、性能优化、安全性和隐私保护、生态系统支持以及个性化需求。荣耀手机在华为的手机产品中被广泛应用，具有自己独特的特点和功能。

此外，荣耀手机新机型普遍采用的是Magic UI系统，而旧机型则普遍使用基于安卓的EMUI系统。部分荣耀机型也支持升级为华为研发的HarmonyOS操作系统。

因此，荣耀手机主要使用的系统是基于安卓操作系统的EMUI定制版，同时也有部分机型支持Magic UI和HarmonyOS。