坚果Pro搭载的系统是 Smartisan OS 3.6，这是一个基于Android 7.1的操作系统。该系统增加了很多有趣的功能，例如智能分析垃圾短信、虚拟来电、One Step（更新到1.5版本，支持以图搜图）和闪念胶囊功能，后者允许用户通过语音实现便捷的备忘录操作。系统界面精致，采用拟物化图标，并提供了丰富的个性化设置选项，如隐藏角标和桌面图标名称，以及单手操作优化。此外，Smartisan OS 3.6还强调提升手机的生产力，提供了如“大爆炸”和“一步”等功能，以优雅的方式增加手机的使用效率。