小鱼缸的过滤系统主要有以下几种：

简单上滤

安装在水族箱的上方，通过潜水泵将水抽入上滤槽中，水流依次经过过滤棉、生化棉及各种滤材的过滤处理，最后通过底部的出水管流回水族箱内。

滴流过滤

过滤槽被设计成多层结构，层数可根据实际需求进行灵活增减。上层为物理过滤室，放置过滤棉和生化棉进行初步过滤，下层则放置多种滤材如生化球、藤棉、玻璃环、石英球、细菌屋等，实现生物过滤。水流经过这些滤材时，会增加水中的容氧量，为好氧性细菌提供理想的生存和繁殖环境。

背滤和侧滤

通过在鱼缸的背部或侧部利用玻璃隔出一个区域作为过滤系统，该区域内被划分成多个小格子，用于摆放滤材和循环泵。系统的一侧设置有溢流口，当水泵将过滤后的水抽回鱼缸时，溢出的水会通过溢流口流入过滤系统的第一格，然后依次经过各种滤材进行过滤，最终从最后一格通过水泵再次被送入鱼缸。

外置过滤桶

是一种封闭式的过滤装置，内部被划分为多层结构，每一层均可用于放置不同类型的过滤材料。通过桶内或桶外的水泵作用，使水族箱中的水持续流经桶内的各层滤材，实现循环过滤的效果。

内置气动过滤器

物理过滤和生化过滤都采用缸内气动过滤的方式进行，但缺点是鱼缸内的废弃物会继续浸入水体中，需要经常取出清洗。

内置背部过滤

通过在鱼缸的背部或侧面划分一个区域作为过滤部件，滤料浸泡在水中，有利于有益细菌的生长，噪音较小，适用于中小型鱼缸。

内置底部过滤

在鱼缸底部装一个过滤装置，底砂和磁环都放在过滤器清洗板上，含氧水从底砂缝中穿过，底砂上有许多有用的细菌，有明显的净化效果，但占用空间较多，操作较繁琐。

顶部过滤

鱼缸上部装有一个过滤水槽，通过潜水泵将水抽入滤料中，经过过滤棉、生化棉及各种滤材后再由底部的出水管回到鱼缸内，适用于各种鱼缸。

悬挂式和瀑布式过滤

利用鱼缸泵把水送至过滤的料中，经过过滤棉或过滤棉球后，再流进缸里，占地面积小，清洗维护方便。

这些过滤系统各有优缺点，选择哪种系统取决于鱼缸的大小、饲养的鱼种和水质状况。一般来说，底滤系统综合过滤能力强，利于保持水质稳定，但占用空间较大；上滤系统结构简单，清洗维护方便，但水流速过快容易导致CO₂流失；外置过滤桶系统密闭性好，适合需要较高过滤效率的鱼缸。