三星手机主要使用的操作系统是 安卓系统（Android）。安卓系统是一种基于Linux的自由及开放源代码的操作系统，主要用于移动设备，如智能手机和平板电脑。三星虽然有能力开发自己的操作系统，但它选择了使用安卓系统，并对其进行了一定程度的定制，以提供更好的用户体验和独特的功能。

三星对安卓系统进行了深度定制，推出了名为 OneUI的用户界面。OneUI是三星在2018年开发者大会上推出的，是原生安卓系统的分支，旨在通过改进和优化来提供更加人性化的使用体验。OneUI具有智能划屏手势导航、深色模式等功能，使用户操作更加简单方便。

因此，无论是从技术角度还是从用户使用的角度来看，三星手机主要运行的是经过精心定制的安卓系统，即OneUI。